在常见的性传播疾病中，淋病、非淋菌性尿道炎、梅毒这三类疾病通常使用抗生素治疗。但在实际上，很多患者对于这类疾病比较隐晦，没有及时到医院治疗或者没有遵医嘱按疗程服药，或是自行使用抗生素治疗，造成抗生素滥用或过度使用，不但容易造成耐药，使得治疗越来越困难，长期使用还会使得体内菌群紊乱，给身体健康造成更大的影响。 在这三类常见性传播感染疾病中，淋病对抗生素的耐药性最强。一旦确诊得了淋病，应立即治疗。目前治疗淋病最常用、最有效的药物是头孢曲松钠（菌必治、头孢三嗪），确诊后只要肌内注射一针即可。过量用药、过度治疗不但无利，而且有害，除了容易诱发耐药菌株的出现外，还容易造成尿道或阴道中真菌的滋生，发生念珠菌性尿道炎或阴道炎。 部分患者在得了淋病后，往往还合并衣原体感染，造成非淋菌性尿道炎。衣原体对抗生素的耐药性虽不常见，但也存在，预防和及时治疗至关重要。衣原体感染的治疗可选用四环素类的药如多西环素、米诺环素；也可选用大环内酯类的药如阿奇霉素、罗红霉素等；还可选用喹诺酮类药物如左氧氟沙星、司帕沙星等。一般服用一个疗程（7-10天）的推荐药物，临床症状都能有所缓解。 梅毒的治疗，推荐注射单剂量苄星青霉素，这是治疗梅毒最有效的药物。而有些患者患了早期梅毒（硬下疳或梅毒早期皮疹），就自己买些抗生素吃，吃药后梅毒的皮疹等症状消失了，但体内的梅毒螺旋体并没有全部杀死，少量潜伏下来转成了隐性梅毒，给身体带来了极大隐患。